Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC23IPQ9Y6Y8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC23IPQ9Y6Y8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms