Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DYNC1LI1Q9Y6G9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms