Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIC4Q9Y696 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIC4Q9Y696 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CLIC4Q9Y696 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms