Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD54BQ9Y620 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms