Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF18Q9Y5U5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF18Q9Y5U5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms