Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PCDHAC2Q9Y5I4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDHAC2Q9Y5I4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHAC2Q9Y5I4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms