Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB9Q9Y5E1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHB9Q9Y5E1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB9Q9Y5E1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB9Q9Y5E1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB9Q9Y5E1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms