Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3D2

MSRB2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2Q9Y3D2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRB2Q9Y3D2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRB2Q9Y3D2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRB2Q9Y3D2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRB2Q9Y3D2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRB2Q9Y3D2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRB2Q9Y3D2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRB2Q9Y3D2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRB2Q9Y3D2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRB2Q9Y3D2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRB2Q9Y3D2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRB2Q9Y3D2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRB2Q9Y3D2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSRB2Q9Y3D2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSRB2Q9Y3D2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRB2Q9Y3D2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms