Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZDHHC9Q9Y397 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZDHHC9Q9Y397 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms