Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAB39Q9Y376 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms