Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPH3AQ9Y2J0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPH3AQ9Y2J0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms