Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GNEQ9Y223 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GNEQ9Y223 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms