Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ53

MGAT4B, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4BQ9UQ53 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MGAT4BQ9UQ53 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGAT4BQ9UQ53 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms