Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP22Q9UPT9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms