Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6BQ9UPQ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNRC6BQ9UPQ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms