Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PCDHA7Q9UN72 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHA7Q9UN72 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCDHA7Q9UN72 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA7Q9UN72 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA7Q9UN72 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA7Q9UN72 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA7Q9UN72 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms