Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMP17Q9ULZ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP17Q9ULZ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms