Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CROTQ9UKG9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CROTQ9UKG9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms