Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW8

ZNF180, Zinc finger protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF180Q9UJW8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF180Q9UJW8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF180Q9UJW8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF180Q9UJW8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms