Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABGEF1Q9UJ41 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGEF1Q9UJ41 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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