Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAX2Q9UIW0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms