Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATPIF1Q9UII2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATPIF1Q9UII2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATPIF1Q9UII2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATPIF1Q9UII2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATPIF1Q9UII2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATPIF1Q9UII2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATPIF1Q9UII2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATPIF1Q9UII2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATPIF1Q9UII2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATPIF1Q9UII2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATPIF1Q9UII2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATPIF1Q9UII2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms