Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPS1Q9UHF7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPS1Q9UHF7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms