Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN2A-AS1Q9UH64 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms