Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-2Q9UD57 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms