Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ORC3Q9UBD5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ORC3Q9UBD5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ORC3Q9UBD5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms