Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN3Q9P1Z3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN3Q9P1Z3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms