Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNIH4Q9P003 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNIH4Q9P003 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH4Q9P003 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH4Q9P003 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH4Q9P003 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH4Q9P003 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH4Q9P003 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH4Q9P003 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH4Q9P003 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH4Q9P003 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH4Q9P003 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH4Q9P003 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH4Q9P003 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH4Q9P003 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms