Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EHD3Q9NZN3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms