Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDE1Q9NZC3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDE1Q9NZC3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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