Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.5 ms