Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY93

DDX56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX56Q9NY93 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX56Q9NY93 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX56Q9NY93 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX56Q9NY93 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX56Q9NY93 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX56Q9NY93 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX56Q9NY93 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX56Q9NY93 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX56Q9NY93 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX56Q9NY93 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX56Q9NY93 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX56Q9NY93 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX56Q9NY93 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX56Q9NY93 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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