Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXSMQ9NWU1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OXSMQ9NWU1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXSMQ9NWU1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms