Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL11Q9NVR0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL11Q9NVR0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHL11Q9NVR0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms