Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV70

EXOC1, Exocyst complex component 1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOC1Q9NV70 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOC1Q9NV70 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOC1Q9NV70 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOC1Q9NV70 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOC1Q9NV70 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms