Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXD4L1Q9NU39 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD4L1Q9NU39 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FOXD4L1Q9NU39 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms