Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATG3Q9NT62 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATG3Q9NT62 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATG3Q9NT62 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ATG3Q9NT62 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATG3Q9NT62 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATG3Q9NT62 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms