Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C19orf12Q9NSK7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C19orf12Q9NSK7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms