Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD18Q9NS91 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms