Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL1Q9NR64 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms