Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSS2Q9NR19 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSS2Q9NR19 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms