Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDLIM7Q9NR12 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDLIM7Q9NR12 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDLIM7Q9NR12 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms