Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYLDQ9NQC7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYLDQ9NQC7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms