Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ94

A1CF, APOBEC1 complementation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1CFQ9NQ94 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A1CFQ9NQ94 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
A1CFQ9NQ94 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A1CFQ9NQ94 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms