Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms