Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB18Q9NP72 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms