Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRMS1Q9HCU9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRMS1Q9HCU9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms