Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTN4Q9HB63 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms