Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPCSQ9HAB8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PPCSQ9HAB8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms