Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVMER34-1Q9H9K5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms